La chiesa di San Leone, situata sul Monte Barbaro, nell’area archeologica dell’antica città di Segesta, fu costruita nel 1442, ad opera dei cittadini di Calatafimi, sulle rovine di un preesistente edificio religioso con impianto basilicale a tre navate terminate con absidi collocabile tra la fine del XII secolo e gli inizi del XIII secolo.
La chiesetta quattrocentesca caduta in rovina nell’Ottocento, presentava internamente una sola navata coperta da una volta a botte, e pavimento a mosaico.